2019年，间充质干细胞干预难治性红斑狼疮的相关项目顺利通过国家科学技术奖初评且建议等级为二等奖。2020年6月，间充质干细胞用于系统性红斑狼疮的新药临床治疗申请获得国家药品审评中心受理，采用的是脐带来源的间充质干细胞。
合作医院孙凌云教授等申报的项目，解决了部分难治性自身免疫病患者常规治疗无效的世界难题，使重症狼疮患者5年死亡率从45%降低为16%，有效率60%，获授权发明专利18项，发表高水平SCI论文151篇。
目前项目组已完成1132例难治性自身免疫病的异体间充质干细胞治疗，为国际开展最早、例数最多、随访时间最长，并结合临床研究数据为难治性红斑狼疮患者制定最适宜临床修复方案。系统性红斑狼疮（SLE）是一种多发于青年女性累及多脏器的自身免疫性疾病。正常的免疫系统可以保护人体免受病毒、细菌等致病微生物的侵扰，但是由于某种目前未知的原因，系统性红斑狼疮（SLE）病人的免疫系统却产生自身抗体，攻击自身细胞，造成组织损伤及器官功能障碍，严重的甚至死亡。据估计，全球共有500万红斑狼疮病人，而每年的新发病例至少有10万人。
其发病原因至今尚未确定，研究表明和遗传、内分泌、感染、免疫异常及环境因素等有关。目前关于系统性红斑狼疮的治疗方法主要包括抗炎药、抗疟药、糖皮质激素、免疫抑制剂等，但没有针对病因的治疗方案，所以治愈系统性红斑狼疮还需要进一步探究。近年来兴起的干细胞技术在SLE（尤其是难治型）的修复中显示良好的效果。因干细胞具有“自我复制”及多向分化潜能，能够调控免疫和靶向修复等特点，可作为理想的“种子”细胞用于病变引起的组织器官的损伤修复。
干细胞干预红斑狼疮的原理：
1、对组织细胞损伤的修复。
2、替代损伤细胞的功能。
3、刺激机体自身细胞的再生功能。
科学研究发现间充质干细胞具有修复系统性红斑狼疮的巨大潜力，间充质干细胞具有免疫调节功能，在特定微环境诱导下对受损组织进行修复，尤其对一些糖皮质激素、环磷酰胺等药物治疗抵抗的顽固性患者，不失为一种十分具有前景的方法，能够帮助缓解或消除临床症状，减轻患者痛苦，改善生活质量。
已经有多项临床前以及临床研究评估了间充质干细胞在多种自身免疫和炎症性疾病中的免疫调节作用，包括系统性红斑狼疮，糖尿病，多发性硬化症，克罗恩病，溃疡性结肠炎和骨关节炎。2019年新疆合作医院在《世界最新医学信息文摘》发表了一项临床研究再次确认了脐带间充质干细胞疗法的效果。
论文中作者认为，脐带间充质干细胞对系统性红斑狼疮予以修复可取得显著效果的机制主要是因为脐带间充质干细胞可分泌出多种细胞因子，当组织损伤发生时，细胞因子会靶向迁移到损伤部位，发挥旁分泌的作用，最终起到修复受损组织的作用。
2012年，合作医院风湿免疫科为21位系统性红斑狼疮患者静脉回输脐带间充质干细胞，显著地降低了系统性红斑狼疮患者尿蛋白水平，降低了患者的疾病活动度，降低了系统性红斑狼疮疾病活动指数评分。在国际上，间充质干细胞修复系统性红斑狼疮也正在火热开展中。2015年至2019年南卡罗来纳医科大学评估了脐带间充质干细胞治疗成人系统性红斑狼疮的有效性和安全性，在对照治疗中，对招募的81名志愿者进行随机分配，目前这项治疗还在进行中。细胞治疗临床专家和伦敦大学在2018年7月1日开始合作研究注射脐带同种异体间充质干细胞治疗难治性系统性红斑狼疮，志愿者在接受第一次同种异体MSC注射后即具有耐受性，此项目预计2021年6月结束。2019年研究人员评估了同种异体间充质干细胞治疗中度至重度系统性红斑狼疮成人患者的安全性，共6名患者参与了治疗。参与者接受单次输注间充质干细胞（剂量为1×10 ^ 6个细胞/ kg），且在治疗期间继续进行标准治疗，该项目目前已经完成并且取得良好的效果。2019年4月，智利大学洛杉矶分校细胞疗法转化研究项目为了研究脐带间充质基质细胞在肾系统性红斑狼疮中的剂量反应和功效，进行了临床评估。共招募39名志愿者，接受标准治疗重症肾病的系统性红斑狼疮患者，逐步增加静脉内间充质干细胞注射的剂量，然后进行治疗。此项目预计2022年12月份结束，目前研究结果尚未发布。多项临床研究已证实间充质干细胞修复SLE患者安全且有效。为了规范间充质干细胞的临床应用，专家组对间充质干细胞修复SLE的适应证、用法、回输次数及细胞数、回输前用药以及回输后合并用药，以及在合并妊娠、感染和肿瘤等情况时的应用制定了推荐意见。
上海本正生物工程有限公司提供的干细胞是从脐带、胎盘中提取的一种修复器官机理的未完全分化的原始细胞，具有自我更新、多项分化和高度繁殖的能力，医学上称为“万能细胞”，它是形成人体各种组织器官的起源细胞。干细胞对临床上一些疑难疾病的治疗如：脑瘫、老年痴呆、脑萎缩、帕金森病、中风、肝硬化、糖尿病、红斑狼疮、股骨头坏死、软骨和关节损伤、心脏和脊髓损伤等，取得显著效果，它拥有更加鲜活细胞能量，可以快速、有效进入体内，分泌多种有益细胞因子，调节体内微环境，激活干细胞再生能力，重启时光之门，追溯青春绽放源头，实现对人体衰老状态减缓，同时有效改善身体亚健康以及预防肿瘤发生。
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