新冠肺炎爆发期间，部分重症患者会患上肺纤维化后遗症，极大影响患者的生活质量。自疫情爆发以来，干细胞多次被提及并多次应用于临床实验，其疗效及安全性也得到了认可。在武汉，超过200例患者曾接受干细胞治疗。从体外回输的间充质干细胞，可以通过其多向分化的机制，再生出新的肺泡组织，修复受损的肺组织，平衡肺部微环境，在8至10天内实现治愈肺纤维化的目标。

大量研究证实，间充质干细胞可归巢至肺部，分化为肺泡上皮细胞、肺血管内皮细胞，从而发挥其保护作用。同时间充质干细胞可修复肺泡上皮细胞、增加肺泡表面活性物质的分泌。显著改善支气管肺发育不良，减轻肺部损伤，恢复肺泡结构及血管密度，降低肺部纤维化水平，改善肺部结构及功能，有效改善肺纤维化及肺部损伤，阻断肺部促炎因子的表达，减低肺部炎症水平，并较终逆转纤维化进程，恢复正常的肺部结构。

卵巢早衰不仅导致不孕，还会增加心血管疾病、骨质疏松症和性功能障碍的发病风险。目前，大多数治疗方法收效甚微，干细胞成为治疗卵巢早衰的研究热点之一。

2021年，发表在Reproductive Sciences和Stem Cell Research & Therapy上的两篇综述均指出，干细胞治疗改善卵巢促卵泡激素微环境，恢复损伤卵巢的功能，改善生殖健康，具有很高的自我更新和自我修复水平，同时能够分化成各种类型的成熟细胞。定植于受损伤部位并进行分化，如卵巢上皮细胞、卵泡细胞等，部分补偿或替代修复其功能。干细胞治疗为卵巢功能早衰患者带来了希望。

胰岛β细胞功能异常导致的胰岛素分泌不足，是I型和II型糖尿病的共同特征之一，许多患者也因此需要终生使用胰岛素进行治疗。

科学家通过实验结果可观察到：胰岛β细胞的潜在来源是干细胞。干细胞具有显著的内源性β细胞再生和胰岛结构恢复，这是由于干细胞分泌作用介导的。干细胞可分泌的至关因子，对表皮细胞生长因子和干细胞因子对β细胞的增殖和凋亡有着至关重要的影响。除了可以分化成IPCs，干细胞还可以迁移到受损的胰岛细胞，帮助分泌多种细胞因子的修复，从而促进胰岛β细胞的再生。干细胞会使胰岛素水平升高，随后改善代谢参数并降低血糖。

脑, 组织由许多不同类型的细胞组成，包括组织和血管。细胞更替的早期尝试已表明，将新的细胞注入受损大脑，不会对大脑造成进一步伤害。

2016年6月2日，美国斯坦福大学医学院的Gary Steinberg在Stroke发文证实，干细胞技术可显著改善患者中风症状，让患者重新获得行走、运动、讲话等生活技能。