炎症性肠道疾病(IBD)包括克罗恩病和溃疡性结肠炎，病因尚不明确，临床表现为：腹泻、腹痛，甚至有血便，是胃肠道疾病中较难修复的病症。其发病率在我国呈逐年上升趋势，且对年轻患者影响较大。
溃疡性结肠炎是结肠黏膜层和黏膜下层连续性炎症，疾病通常先累及直肠，逐渐向全结肠蔓延；克罗恩病可累及全消化道，为非连续性全层炎症，最常累及部位为末端回肠、结肠和肛周。目前炎症性肠道疾病(IBD)以内科药物调理为主，外科手术主要解决IBD的并发症。由于人们对引起该疾病复杂的易感基因、表观遗传和内源性或外源性诱因，机体自身的免疫调节功能等多层次因素并没有全面理解。所以，克罗恩病和溃疡性结肠炎这两种疾病用上述的常规疗法都没有起到很好的修复效果。随着医学科技的研究进展，干细胞调理炎症性肠道疾病的作用逐渐被认可。越来越多的研究者开始使用干细胞来调理这类难治性疾病。研究发现，干细胞不仅可以修复损伤组织，而且能下调炎症，使伤口组织细胞再生，而干细胞最为理想的来源主要有间充质干细胞，这使得间充质干细胞在肠道疾病的修复研究中有很好的应用前景。2020年2月，欧洲克罗恩病和结肠炎组织(ECCO)正式刊发了克罗恩病手术治疗指南提到：异基因间充质干细胞是一种安全有效的修复克罗恩病复杂肛周瘘的方法；间充质干细胞由于具有良好的耐受性和安全性对于克罗恩病和复杂肛瘘患者可能有明显效果。
国内已有研究证明间充质干细胞具有强大的分化及旁分泌作用，回输干细胞后它会自主趋附到肠结缔组织块表面炎症部位，间充质干细胞可分泌多种细胞因子及营养因子，促进肠上皮细胞再生，以细胞新老更替方式修复受损组织，间充质干细胞也可通过分化作用分化为结肠上皮细胞来发挥修复功能。
体外实验已证明，干细胞对于先天免疫及获得性免疫都具有调节作用。
它不但可以干扰补体系统、Toll样受体信号传导、巨噬细胞、树突细胞、中性粒细胞、自然杀伤细胞的功能，还能影响T细胞功能，诱导调节性T细胞，对B细胞也有抑制作用。
干细胞对免疫系统的影响表现为双向调节，在干扰素-γ、肿瘤坏死因子-α和IL-1β等可溶性促炎症性细胞因子的影响下，干细胞分化为免疫抑制的表型，并通过直接接触发挥作用；而当活动性感染发生时，干细胞则分化为促炎症表型。
干细胞可以在放射性肠炎肠道趋附并分化成肠上皮的肌成纤维细胞，这种细胞可以直接分泌和旁分泌多种细胞因子，组成肠道干细胞微环境。
这些细胞因子可以参与调控肠道上皮细胞的增殖和分化、保护黏膜、促进伤口愈合、协助水和电解质的运输、促进细胞外基质的新陈代谢和基膜的生长等过程。
间充质干细胞来源充足、免疫原性低、临床需求大，这就使其具备了像资本或者能源一样的流动性和驱动力。间充质干细胞不仅具有广泛的临床应用价值，还具有很高的研究价值，这就决定了其重要的战略价值。间充质干细胞具有多向分化潜能，但不能自发分化。其在体外特定诱导条件(如多种细胞因子、激素和化学药物等)下，可分化为星形胶质细胞、成骨细胞、软骨细胞、肌腱细胞、脂肪细胞等多种细胞，还可跨胚层分化为神经细胞和胰岛细胞等。但其诱导因子发挥作用的机制、诱导因子间相互作用、最佳效量比和序贯应用方法等均对间充质干细胞应用起重要决定作用。而体内输入间充质干细胞诱导分化比体外更复杂。目前学术界观点认为，经相应微环境信号诱导后，回输进体内的间充质干细胞至少可向3种基本细胞类型分化：
例如，间充质干细胞可分化为心肌细胞、平滑肌细胞和血管内皮细胞等，均为心脏组织重要成分。
近期研究结果显示：间充质干细胞修复IBD、心肌梗死、肝硬化、脊髓损伤、肌萎缩侧索硬化等安全有效，可通过调节性T淋巴细胞降低炎症相关肿瘤发病率。间充质干细胞除分布于脐带，还广泛分布于羊水、胎盘、胎肺、胎肾、脐血、外周血、骨骼肌、肌腱、滑膜、脂肪、牙髓等不同组织，具有多向分化潜能，可定向分化为造血细胞以外的神经胶质细胞、成骨细胞、成软骨细胞、肌细胞、心肌细胞、平滑肌细胞、肌腱细胞、脂肪细胞等多种细胞，支持造血，对造血干细胞有扩增作用。间充质干细胞有贴壁生长、低免疫原性等特性，在体外易被分离和扩增，相信其在未来医学领域应用前景广阔。
上海本正生物工程有限公司提供的干细胞是从脐带、胎盘中提取的一种修复器官机理的未完全分化的原始细胞，具有自我更新、多项分化和高度繁殖的能力，医学上称为“万能细胞”，它是形成人体各种组织器官的起源细胞。干细胞对临床上一些疑难疾病的治疗如：脑瘫、老年痴呆、脑萎缩、帕金森病、中风、肝硬化、糖尿病、红斑狼疮、股骨头坏死、软骨和关节损伤、心脏和脊髓损伤等，取得显著效果，它拥有更加鲜活细胞能量，可以快速、有效进入体内，分泌多种有益细胞因子，调节体内微环境，激活干细胞再生能力，重启时光之门，追溯青春绽放源头，实现对人体衰老状态减缓，同时有效改善身体亚健康以及预防肿瘤发生。
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