皮肤系统：干细胞疗法在皮肤病治疗中的应用日益广泛，特别是在银屑病、系统性红斑狼疮和白癜风等难治性疾病中展现出显著疗效。例如，一项针对19岁男性患者的临床试验显示，同种异体间充质干细胞治疗在5次输注后实现了银屑病的完全消退，且随访三年未复发。
骨骼系统：干细胞疗法在骨折修复、骨关节炎和骨质疏松症等骨骼疾病的治疗中展现出巨大潜力。对于复杂骨折如开放性骨折、粉碎性骨折等，干细胞治疗提供了新的治疗选择，有助于促进骨折愈合，减少并发症。此外，干细胞治疗膝骨关节炎也在短时间内显著改善了患者的疼痛评分和关节功能。
肌肉系统：干细胞疗法在肌腱疾病如肩肌撕裂和跟腱炎等治疗中显示出潜力。通过干细胞治疗肩肌完全撕裂的研究表明，该方法促进了受损肌腱的愈合，减少了疼痛和炎症，改善了肌腱强度和灵活性。
神经系统：干细胞疗法为帕金森病、脑瘫等神经系统疾病的治疗提供了新的希望。例如，合作医院开展的“利用干细胞治疗帕金森病临床研究”取得突破性进展，通过静脉回输干细胞治疗帕金森病的方法被证明安全有效。
心血管系统：干细胞疗法在促进心肌再生、改善心功能方面展现出潜力。多项研究表明，干细胞有助于促进心肌再生，减少心肌梗死后心肌细胞的凋亡，从而改善心功能。
淋巴系统：干细胞疗法在免疫系统疾病如糖尿病、白血病等治疗中展现出显著疗效。干细胞已成为治疗急性白血病、再生障碍性贫血等血液系统恶性疾病的有效手段，能够显著延长患者的生存期。
呼吸系统：干细胞疗法在促进肺组织修复、改善肺功能方面展现出潜力。间充质干细胞治疗肺纤维化的临床试验表明，该方法能够减轻肺组织纤维化程度，改善肺功能。
消化系统：干细胞疗法在促进肝细胞再生、改善肝功能方面展现出潜力。干细胞治疗肝硬化的临床试验表明，该方法能够促进肝细胞再生，改善肝功能，提高患者的生活质量。
泌尿系统：干细胞疗法在促进肾组织修复、改善肾功能方面展现出潜力。间充质干细胞治疗尿毒症的临床试验表明，该方法能够改善肾功能，修复肾脏组织，提高患者的生活质量。
内分泌系统：干细胞疗法在促进内分泌腺体功能恢复方面展现出潜力。虽然干细胞疗法在甲状腺功能异常治疗中的具体应用尚需进一步研究，但其潜力不容忽视。在糖尿病治疗中，干细胞疗法也取得了显著成效，许多患者通过干细胞治疗成功摆脱了糖尿病的困扰。
生殖系统：干细胞疗法在促进生殖细胞再生、改善生育功能方面展现出潜力。脐带间充质干细胞卵巢内移植治疗卵巢早衰的临床研究表明，该方法能够改善卵巢功能，提高患者的生育能力。
